科研结合基因组及肠道菌群的培养以改善

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本文由木子编译,董小橙、江舜尧编辑。

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导读

了解肠道微生物组功能需要培养细菌进行实验验证,引用细菌基因组序列来解释元基因组数据集并指导功能分析。我们展示了人类胃肠道细菌培养标本(HBC),这是一套包含个全基因组测序的细菌分离物的综合样本,代表了在人类胃肠道微生物群中发现的31个科中的种(个新物种)。HBC使来自人类胃肠道微生物群的细菌基因组数量增加了37%。由此产生的全球人类胃肠道细菌基因组采集(HGG)在13,个鸟枪法测序的元基因组样本中按丰度对83%的属进行分类,与人类微生物组计划(HMP)基因组相比提高了61%的分类类别,几乎50%的序列实现了亚种级分类。胃肠道细菌参考序列资源的改善,避免了对原基因组重新组装的依赖,实现了对人体胃肠道微生物群的精确和经济有效的鸟枪原基因组分析。

论文ID

原名:Ahumangutbacterialgenomeandculturecollectionforimprovedmetagenomicanalyses

译名:人类肠道细菌基因组及培养收集以改进宏基因组分析

期刊:Naturebiotechnology

IF:35.

发表时间:年2月

通信作者:TrevorD.Lawley

通信作者单位:Host-MicrobiotaInteractionsLaboratory,Well


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